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PRScs源代码详解以及代码步骤测试

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资源介绍:

PRScs 是一种用于计算多性状基因风险评分(Polygenic Risk Scores, PRS)的方法,特别适用于全基因组关联分析(GWAS)数据。PRScs 是 Polygenic Risk Score - Continuous Shrinkage 的缩写,它的主要特点是在计算 PRS 时引入了连续收缩(continuous shrinkage)模型,从而对多种基因变异进行联合分析。 PRScs 的主要特点包括: 1.贝叶斯模型: PRScs 基于贝叶斯框架,使用连续收缩先验(continuous shrinkage prior),能够动态地调整每个 SNP 的权重,从而优化 PRS 的计算。传统的 PRS 方法通常假设所有 SNP 贡献相同,而 PRScs 可以根据数据对 SNP 贡献进行加权。 2. 利用外部信息: PRScs 允许使用外部信息(如 LD 参考面板)来提高 PRS 的预测能力。LD 参考面板可以是来自相同或不同人群的基因数据,这可以帮助更好地捕捉 SNP 之间的连锁不平衡(LD)结构。
SNP A1 A2 BETA SE rs9605903 T C -0.011400 8.117350e-03 rs5746647 G T -0.007900 1.506482e-02 rs5747999 C A -0.006000 8.780564e-03 rs2845380 A G 0.010700 7.281439e-03 rs2247281 G A 0.011700 6.950269e-03 rs2845346 C T 0.010700 8.055794e-03 rs2845347 C T 0.010900 8.081235e-03 rs1807512 T C 0.015700 7.313244e-03 rs5748593 T C 0.014900 8.006321e-03 rs9606468 T C -0.000100 8.141474e-03 rs4819535 T C -0.014100 1.285481e-02 rs5748648 G A -0.015600 1.332198e-02 rs738045 G A -0.002600 6.719373e-03 rs7284996 T C -0.002400 6.794029e-03 rs2385714 T C -0.000400 6.874436e-03 rs2080203 T G 0.001300 7.302171e-03 rs2072466 C T 0.016300 8.696611e-03 rs9605155 G T 0.007300 6.232680e-03 rs874835 A G 0.007200 6.257647e-03 rs874836 A G 0.007800 8.879284e-03 rs5994031 C T 0.001700 6.383523e-03 rs2215842 C T 0.001200 6.186549e-03 rs2192431 T G -0.012500 9.361660e-03 rs175138 G A 0.001600 6.112273e-03 rs175139 C T 0.001700 6.389754e-03 rs983305 G A 0.007000 6.251129e-03 rs9606478 G A 0.012500 7.083495e-03 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资源文件列表:

PRScs.zip 大约有14个文件
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  2. PRScs/PRScs.ipynb 8.59KB
  3. PRScs/PRScs_test.ipynb 4.01KB
  4. PRScs/gigrnd.ipynb 14.16KB
  5. PRScs/mcmc_gtb.ipynb 16.69KB
  6. PRScs/mcmc_gtb_test.ipynb 17.93KB
  7. PRScs/parse_genet.ipynb 12.77KB
  8. PRScs/parse_genet_test.ipynb 32.8KB
  9. PRScs/res/
  10. PRScs/test_data/
  11. PRScs/test_data/sumstats.txt 35.46KB
  12. PRScs/test_data/sumstats_pval.txt 35.46KB
  13. PRScs/test_data/sumstats_se.txt 35.46KB
  14. PRScs/test_data/test.bim 27.18KB
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`diy-uview-ui` 是基于`uview-ui 1.8.3` 版本改造兼容uniapp vue3插件库
基于uview改造兼容uniapp vue3插件库扩展了二维码、条形码、支持H5扫码、车牌号码、单选复选按钮、气泡弹窗、矩阵单选、多选、输入、评分、微信隐身协议、uniapp APP版本升级、签名、SKU商品多规格、树形展示、树形下拉、滑动验证、滑动图片验证、分页、宫格抽奖、大转盘抽奖等组件。
DirectShow过滤器-写WAV音频文件过滤器
本过滤器将PCM音频流,或ADPCM,IEEE_FLOAT,ALAW,MULAW,GSM610音频流写入WAV音频文件。 参见介绍文章:https://blog.csdn.net/h3974/article/details/141200132?csdn_share_tail=%7B%22type%22%3A%22blog%22%2C%22rType%22%3A%22article%22%2C%22rId%22%3A%22141200132%22%2C%22source%22%3A%22h3974%22%7D 过滤器名称:写WAV 过滤器GUID:{CF704A9C-0C67-4712-BA33-DD0AAE01A232} DLL注册函数名:DllRegisterServer 删除注册函数名:DllUnregisterServer 过滤器有1个输入引脚。 输入引脚标识:In 输入引脚媒体类型: 主要类型:MEDIATYPE_Audio 子类型:MEDIASUBTYPE_PCM等