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ArgoWorkflow教程(三)---使用 Artifacts 实现步骤间文件共享

编程知识
2024年08月29日 11:53

argoworkflow-3-artifacts.png

上一篇我们分析了 Workflow、WorkflowTemplate、template 之间的关系。本篇主要分析如何在 argo-workflow 中使用 S3 存储 artifact 实现步骤之间的文件共享。

本文主要解决两个问题:

  • 1)artifact-repository 如何配置
  • 2)Workflow 中如何使用

1. artifact-repository 配置

ArgoWorkflow 对接 S3 实现持久化,依赖于 artifact-repository 配置。

有三种方式设置相关配置:

  • 1)全局配置:在 workflow-controller deploy 中直接通过配置文件方式写入 S3 相关配置,指定全局使用的artifactRepository, 该方式优先级最低,可以被后续两种方式替换。
  • 2)命名空间默认配置:ArgoWorkflow 会在 Workflow 所在命名空间寻找当前命名空间的默认配置,该方式配置优先级第二,可以覆盖全局指定的配置。
    • 规定:会在 Workflow 所在命名空间寻找名为 artifact-repositories 的 Configmap 作为配置。
  • 3)Workflow 中指定配置:还可以在 Workflow 中显式指定使用哪个 artifact-repository,该方式优先级最高。

注意📢不管什么方式指定 artifact-repository,其中存储 S3 AKSK 信息的 Secret 都必须同步到 Workflow 所在的命名空间才行

优先级 InWorkflowConfig > Namespace > Global

全局配置

以 helm 方式部署的 ArgoWorkflow 的话默认就会以这种形式指定配置。

workflow-controller 的 deployment yaml 如下:

apiVersion: apps/v1
kind: Deployment
metadata:
  name: argo-workflow-argo-workflows-workflow-controller
  namespace: argo-dev
spec:
  template:
    metadata:
    spec:
      containers:
      - args:
        - --configmap
        - argo-workflow-argo-workflows-workflow-controller-configmap
        - --executor-image
        - quay.io/argoproj/argoexec:v3.4.11
        - --loglevel
        - info
        - --gloglevel
        - "0"
        - --log-format
        - text

可以看到在启动命令中以 --configmap argo-workflow-argo-workflows-workflow-controller-configmap 方式指定了配置文件来源的 Configmap。

这个 Configmap 的内容如下:

apiVersion: v1
data:
  # ... 省略
  artifactRepository: |
    s3:
      endpoint: minio.default.svc:9000
      bucket: argo
      insecure: true
      accessKeySecret:
        name: my-s3-secret
        key: accessKey
      secretKeySecret:
        name: my-s3-secret
        key: secretKey
kind: ConfigMap
metadata:
  name: argo-workflows-workflow-controller-configmap
  namespace: argo

包括了 S3 的 endpoint、bucket、aksk 等信息,借助这些信息 Workflow 就可以访问 S3 了。

命名空间默认配置

根据当前实现,ArgoWorkflow 会优先使用 Workflow 所在命名空间下的默认 artifactRepository 配置

默认会使用名为 artifact-repositories 的 Configmap 作为当前命名空间下 Workflow 的 artifactRepository 配置,Configmap 中的内容大概长这样:

注意:Configmap 名必须是 artifact-repositories

apiVersion: v1
kind: ConfigMap
metadata:
  # If you want to use this config map by default, name it "artifact-repositories". Otherwise, you can provide a reference to a
  # different config map in `artifactRepositoryRef.configMap`.
  name: artifact-repositories
  annotations:
    # v3.0 and after - if you want to use a specific key, put that key into this annotation.
    workflows.argoproj.io/default-artifact-repository: my-artifact-repository
data:
  my-artifact-repository: |
    s3:
      bucket: lixd-argo
      endpoint: minio.argo-dev.svc:9000
      insecure: true
      accessKeySecret:
        name: my-s3-secret
        key: accessKey
      secretKeySecret:
        name: my-s3-secret
        key: secretKey
 # 可以写多个 Repository
 my-artifact-repository2: ...

Data 中的每一个 Key 对应一个 Repository, 然后使用 workflows.argoproj.io/default-artifact-repository annotation 来指定默认使用哪个 artifactRepository

比如这里就指定了 my-artifact-repository 为默认 artifactRepository.

Workflow 中指定配置

除此之外,还可以直接在 Workflow 中指定具体要使用哪个 artifactRepository。

spec:
  artifactRepositoryRef:
    configMap: my-artifact-repository # default is "artifact-repositories"
    key: v2-s3-artifact-repository # default can be set by the `workflows.argoproj.io/default-artifact-repository` annotation in config map.

需要指定 Configmap 以及具体的 Key 来找到唯一的 artifactRepository。

只会在当前命名空间下找,因此需要确保这个 Configmap 存在。

或者直接把 S3 配置写到 Workflow 里(不推荐),就像这样:

  templates:
  - name: artifact-example
    inputs:
      artifacts:
      - name: my-input-artifact
        path: /my-input-artifact
        s3:
          endpoint: s3.amazonaws.com
          bucket: my-aws-bucket-name
          key: path/in/bucket/my-input-artifact.tgz
          accessKeySecret:
            name: my-aws-s3-credentials
            key: accessKey
          secretKeySecret:
            name: my-aws-s3-credentials
            key: secretKey
    outputs:
      artifacts:
      - name: my-output-artifact
        path: /my-output-artifact
        s3:
          endpoint: storage.googleapis.com
          bucket: my-gcs-bucket-name
          # NOTE that, by default, all output artifacts are automatically tarred and
          # gzipped before saving. So as a best practice, .tgz or .tar.gz
          # should be incorporated into the key name so the resulting file
          # has an accurate file extension.
          key: path/in/bucket/my-output-artifact.tgz
          accessKeySecret:
            name: my-gcs-s3-credentials
            key: accessKey
          secretKeySecret:
            name: my-gcs-s3-credentials
            key: secretKey
          region: my-GCS-storage-bucket-region
    container:
      image: debian:latest
      command: [sh, -c]
      args: ["cp -r /my-input-artifact /my-output-artifact"]

只会在当前命名空间下找,因此需要确保这个 Configmap 存在。

小结

包括三种方式:

  • 1)全局配置
  • 2)命名空间默认配置
  • 3)Workflow 中指定配置

注意📢:由于 S3 AKSK 以 Secret 方式存储,因此三种配置方式都需要将该 Secret 同步到 Workflow 所在命名空间,否则无法在 Pod 中使用,导致 Workflow 无法正常运行。

如果 ArgoWorkflow 能自动接管就好了,可以使用 https://github.com/mittwald/kubernetes-replicator 来自动同步

三种方式的区别

  • 全局配置全局只需要一个 Configmap 来指定 S3 信息即可,所有 Workflow 都使用该 S3 配置,简单,但是不够灵活。
  • 命名空间默认配置:该方式可以为不同命名空间配置不同的 S3,但是需要在每个命名空间都创建一个 Configmap。
  • Workflow 中指定配置:这种方式最灵活,可以为不同 Workflow 指定不同 S3,但是需要创建很多 Configmap。

使用场景

如果全局只有一个 S3 配置,那就使用 全局配置方式,最简单。

如果租户间使用命名空间隔离,使用不同 S3,那使用命名空间默认配置方式就刚好

以上都不满足的时候,才建议使用 Workflow 中指定配置方式。

2. Workflow 中使用 artifact

key-only-artifacts

当 Workflow 中不显式指定 S3 配置信息时,argo 会按照前面的优先级自动寻找 artifact-repository 配置。

优先使用 Namespace 下的配置,没有则使用全局配置

一个完整的 Demo 如下:

apiVersion: argoproj.io/v1alpha1
kind: Workflow
metadata:
  generateName: artifact-passing-
spec:
  entrypoint: artifact-example
  templates:
  - name: artifact-example
    steps:
    - - name: generate-artifact
        template: whalesay
    - - name: consume-artifact
        template: print-message
        arguments:
          artifacts:
          # bind message to the hello-art artifact
          # generated by the generate-artifact step
          - name: message
            from: "{{steps.generate-artifact.outputs.artifacts.hello-art}}"

  - name: whalesay
    container:
      image: docker/whalesay:latest
      command: [sh, -c]
      args: ["cowsay hello world | tee /tmp/hello_world.txt"]
    outputs:
      artifacts:
      # generate hello-art artifact from /tmp/hello_world.txt
      # artifacts can be directories as well as files
      - name: hello-art
        path: /tmp/hello_world.txt

  - name: print-message
    inputs:
      artifacts:
      # unpack the message input artifact
      # and put it at /tmp/message
      - name: message
        path: /tmp/message
    container:
      image: alpine:latest
      command: [sh, -c]
      args: ["cat /tmp/message"]

第一个步骤,通过

第一个步骤,通过 tee 命令创建了一个文件并通过 outputs 进行输出,由于指定的是 artifacts,因此这个文件会被存储到 S3。

然后第二个步骤指定 inputs.artifacts 从 S3 读取名为 message 的 artifact 并存储到 /tmp/message 目录。

问题来了第二步中读取的 artifact 是从哪儿来的呢,就是 steps 中通过 arguments.artifacts 指定的,通过 name 进行关联。

整个逻辑和 parameter 基本一致

  • 1)whalesay template 通过 outputs.artifacts 来申明当前 template 会输出一个 artifact。

  • 2)print-message 中通过 inputs.artifacts 申明需要一个 artifact,并指定存储位置

  • 3)steps 在使用该 template 时,通过 arguments.artifacts 来指定一个 artifact,这个 artifact 来源就是 1 中的 output,通过{{steps.generate-artifact.outputs.artifacts.$name}} 语法引用。

	artifact-passing-vzp2r-1469537892:
      boundaryID: artifact-passing-vzp2r
      displayName: generate-artifact
      finishedAt: "2024-03-29T08:42:34Z"
      hostNodeName: lixd-argo
      id: artifact-passing-vzp2r-1469537892
      message: 'Error (exit code 1): You need to configure artifact storage. More
        information on how to do this can be found in the docs: https://argo-workflows.readthedocs.io/en/release-3.5/configure-artifact-repository/'
      name: artifact-passing-vzp2r[0].generate-artifact

artifact 压缩

默认情况下,所有的 artifact 会被打成 tar 包并 gzip 压缩,可以通过archive 字段来配置压缩情况:

  • 默认行为:tar + gzip
  • 可选关闭 tar+ gzip
  • 或者配置 gzip 压缩等级
<... snipped ...>
    outputs:
      artifacts:
        # default behavior - tar+gzip default compression.
      - name: hello-art-1
        path: /tmp/hello_world.txt

        # disable archiving entirely - upload the file / directory as is.
        # this is useful when the container layout matches the desired target repository layout.   
      - name: hello-art-2
        path: /tmp/hello_world.txt
        archive:
          none: {}

        # customize the compression behavior (disabling it here).
        # this is useful for files with varying compression benefits, 
        # e.g. disabling compression for a cached build workspace and large binaries, 
        # or increasing compression for "perfect" textual data - like a json/xml export of a large database.
      - name: hello-art-3
        path: /tmp/hello_world.txt
        archive:
          tar:
            # no compression (also accepts the standard gzip 1 to 9 values)
            compressionLevel: 0
<... snipped ...>

Artifact 垃圾回收

所有 Artifact 都会上传到 S3,为了保证 S3 不被填满,垃圾清理是个问题。

好消息是,argo-workflow 3.4 开始,可以在 Workflow 中添加配置来实现自动删除不需要的 Artifacts。

当前提供两种回收策略,分别是:

  • OnWorkflowCompletion:工作流运行完成后就删除
  • OnWorkflowDeletion:工作流被删除时才删除

同时可以统一为 Workflow 中的所有 artifact 配置回收策略,也可以单独为每一个 artifact 配置回收策略。

Demo 如下:

apiVersion: argoproj.io/v1alpha1
kind: Workflow
metadata:
  generateName: artifact-gc-
spec:
  entrypoint: main
  artifactGC:
    strategy: OnWorkflowDeletion  # default Strategy set here applies to all Artifacts by default
  templates:
    - name: main
      container:
        image: argoproj/argosay:v2
        command:
          - sh
          - -c
        args:
          - |
            echo "can throw this away" > /tmp/temporary-artifact.txt
            echo "keep this" > /tmp/keep-this.txt
      outputs:
        artifacts:
          - name: temporary-artifact
            path: /tmp/temporary-artifact.txt
            s3:
              key: temporary-artifact.txt
          - name: keep-this
            path: /tmp/keep-this.txt
            s3:
              key: keep-this.txt
            artifactGC:
              strategy: Never   # optional override for an Artifact

核心部分如下:

spec:
  entrypoint: main
  # 为 Workflow 中的所有 artifact 统一配置
  artifactGC:
    strategy: OnWorkflowDeletion  # default Strategy set here applies to all Artifacts by default
# 单独指定 artifact 的回收策略
			outputs:
        artifacts:
          - name: temporary-artifact
            artifactGC:
              strategy: Never   # optional override for an Artifact

注意事项:为了避免相同工作流并发运行时,artifact 被误删除的问题,可以为不同工作流配置不同的 artifact repository。

forceFinalizerRemoval

argo-workflow 会启动一个 <wfName>-artgc-* 格式命名的 Pod 来执行垃圾回收工作,如果执行失败,整个 Workflow 也会被标记为失败。

同时由于finalizers 没有被删除掉

apiVersion: argoproj.io/v1alpha1
kind: Workflow
  finalizers:
  - workflows.argoproj.io/artifact-gc

会导致这个 Workflow 无法删除,可以执行以下命令移除

kubectl patch workflow my-wf \
    --type json \
    --patch='[ { "op": "remove", "path": "/metadata/finalizers" } ]'

为了优化体验,argo-workflow 3.5 版本新增了 forceFinalizerRemoval 参数

spec:
  artifactGC:
    strategy: OnWorkflowDeletion 
    forceFinalizerRemoval: true

只要forceFinalizerRemoval 设置为 true,即时 GC 失败也会移除 finalizers。

常用 Artifacts 扩展

除了 S3 Artifacts 之外,为了便于使用, argo-workflow 还内置了 git、http 方式来获取 artifact。

可以直接从指定 git 仓库 clone 代码,或者从指定 url 下载文件,就像这样:

apiVersion: argoproj.io/v1alpha1
kind: Workflow
metadata:
  generateName: hardwired-artifact-
spec:
  entrypoint: hardwired-artifact
  templates:
  - name: hardwired-artifact
    inputs:
      artifacts:
      # Check out the main branch of the argo repo and place it at /src
      # revision can be anything that git checkout accepts: branch, commit, tag, etc.
      - name: argo-source
        path: /src
        git:
          repo: https://github.com/argoproj/argo-workflows.git
          revision: "main"
      # Download kubectl 1.8.0 and place it at /bin/kubectl
      - name: kubectl
        path: /bin/kubectl
        mode: 0755
        http:
          url: https://storage.googleapis.com/kubernetes-release/release/v1.8.0/bin/linux/amd64/kubectl
      # Copy an s3 compatible artifact repository bucket (such as AWS, GCS and MinIO) and place it at /s3
      - name: objects
        path: /s3
        s3:
          endpoint: storage.googleapis.com
          bucket: my-bucket-name
          key: path/in/bucket
          accessKeySecret:
            name: my-s3-credentials
            key: accessKey
          secretKeySecret:
            name: my-s3-credentials
            key: secretKey
    container:
      image: debian
      command: [sh, -c]
      args: ["ls -l /src /bin/kubectl /s3"]

3. Demo

测试点:

  • 1)创建到 Workflow 对应 Namespace 是否能正常使用
  • 2)将S3 配置创建到 Argo 部署的 Namespace 是不是可以不需要进行同步了。

Configmap:

  • Name:argo-workflow-argo-workflows-workflow-controller-configmap
  • Namespace:argo-dev
  • Key:artifactRepository

Minio 准备

部署一个 local-path-storage csi,如果有别的 csi 也可以跳过这一步

kubectl apply -f https://raw.githubusercontent.com/rancher/local-path-provisioner/v0.0.24/deploy/local-path-storage.yaml

然后部署 minio

helm install minio oci://registry-1.docker.io/bitnamicharts/minio
    my-release-minio.default.svc.cluster.local
   
   export ROOT_USER=$(kubectl get secret --namespace default my-release-minio -o jsonpath="{.data.root-user}" | base64 -d)
   export ROOT_PASSWORD=$(kubectl get secret --namespace default my-release-minio -o jsonpath="{.data.root-password}" | base64 -d)

配置 artifact-repository

cm.yaml 完整内容如下:

apiVersion: v1
kind: ConfigMap
metadata:
  name: artifact-repositories
  annotations:
    workflows.argoproj.io/default-artifact-repository: my-artifact-repository
data:
  my-artifact-repository: |
    s3:
      bucket: argo
      endpoint: minio.default.svc.cluster.local:9000
      insecure: true
      accessKeySecret:
        name: my-s3-secret
        key: accessKey
      secretKeySecret:
        name: my-s3-secret
        key: secretKey

secret.yaml 完整内容如下:

apiVersion: v1
stringData:
  accessKey: admin
  secretKey: minioadmin
kind: Secret
metadata:
  name: my-s3-secret
type: Opaque

创建 artifact repository 配置

kubectl apply -f cm.yaml
kubectl apply -f secret.yaml

Workflow 中使用artifact

两个步骤:

  • generate:生成一个文件,并通过 outputs.artifact 写入 S3
  • consume:使用 inputs.artifact 从 S3 读取文件并打印内容

workflow.yaml 完整内容如下:

apiVersion: argoproj.io/v1alpha1
kind: Workflow
metadata:
  generateName: key-only-artifacts-
spec:
  entrypoint: main
  templates:
    - name: main
      dag:
        tasks:
          - name: generate
            template: generate
          - name: consume
            template: consume
            dependencies:
              - generate
    - name: generate
      container:
        image: argoproj/argosay:v2
        args: [ echo, hello, /mnt/file ]
      outputs:
        artifacts:
          - name: file
            path: /mnt/file
            s3:
              key: my-file
    - name: consume
      container:
        image: argoproj/argosay:v2
        args: [cat, /tmp/file]
      inputs:
        artifacts:
          - name: file
            path: /tmp/file
            s3:
              key: my-file

创建 Workflow

kubectl create -f workflow.yaml 

等待运行完成

[root@lixd-argo artiface]# kubectl get wf
NAME                                  STATUS      AGE     MESSAGE
key-only-artifacts-9r84h              Succeeded   2m30s

S3 查看文件

到 S3 中查看文件是否存在

可以看到,在 argo bucket 下有一个名为 my-file的文件存在,而且 context-type 是 application/gzip,这也验证了 argo 会对 artifact 执行 tar+gzip。

argo-artifact-s3

4. 小结


【ArgoWorkflow 系列】持续更新中,搜索公众号【探索云原生】订阅,阅读更多文章。


本文主要分析了 argo 中的 artifact 使用,包括如何配置 artifact-repository:

包括三种方式:

  • 1)全局配置
  • 2)命名空间默认配置
  • 3)Workflow 中指定配置

以及如何在 Workflow 中使用 artifact 并通过一个 Demo 进行演示。

From:https://www.cnblogs.com/KubeExplorer/p/18386454
本文地址: http://shuzixingkong.net/article/1551
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